「とはいえ」は主に書き言葉、「とはいうものの」は書き言葉と話し言葉の両方で使われます。ただし、話し言葉としては同じ意味の「とは言っても」のほうがよく使われているように思います。

なお、「とはいうものの」の後の言葉を濁す言い方がありますが、「とはいえ」ではあまり使われません。

例

社長に相談すればいい、とはいうものの・・・。

（搬运自hinative）